高通量蛋白质相互作用（High-throughput Protein-Protein Interaction, HT-PPI）是指通过高效、自动化的实验技术，快速检测和分析大量蛋白质之间相互作用的过程。蛋白质是生物体中执行几乎所有功能的核心分子，它们之间的相互作用在细胞功能、信号传导、代谢过程和基因调控等方面起着至关重要的作用。理解蛋白质相互作用网络，可以揭示细胞的工作机制及其在不同生理和病理状态下的变化。高通量蛋白质相互作用方法的应用非常广泛。首先，在基础研究中，通过构建蛋白质相互作用网络图，可以帮助科学家们理解细胞内复杂的生物学过程。这对于解析信号转导途径、蛋白质复合物的形成及其功能机制等具有意义。其次，在医学研究中，高通量蛋白质相互作用技术可以用于识别疾病相关蛋白质及其相互作用网络，从而发现新的药物靶点和生物标志物。例如，通过分析癌细胞中的蛋白质相互作用，研究人员能够找到特定蛋白质的异常相互作用，这可能是导致癌症发生的关键因素。在药物开发过程中，高通量蛋白质相互作用技术还可用于筛选药物候选分子与目标蛋白的相互作用效率，提高药物研发的成功率和效率。

一、高通量蛋白质相互作用分析流程

1、选择合适的检测方法

常用的高通量蛋白质相互作用检测方法包括酵母双杂交系统、亲和纯化-质谱联用（AP-MS）、蛋白质微阵列技术等。根据研究目标和样品特性选择最适合的方法。

2、样品制备

根据所选方法的要求进行蛋白质样品的提取和纯化。确保样品的质量和浓度，以获得准确的相互作用数据。

3、数据分析与验证

收集实验数据后，需要通过生物信息学工具进行数据分析，构建蛋白质相互作用网络。最后，通过独立实验方法（如免疫共沉淀）验证关键的蛋白质相互作用。

二、高通量蛋白质相互作用的技术优势

1、快速高效

能够在短时间内分析成千上万种蛋白质相互作用，极大提高研究效率。

2、系统性强

提供全局性的蛋白质相互作用网络信息，有助于全面理解生物学过程。

3、应用范围广

适用于基础研究、疾病研究、药物开发等多个领域。

三、高通量蛋白质相互作用的局限性

1、假阳性结果

某些高通量技术可能产生误报，需要进一步验证。

2、复杂性高

数据分析和解释需要较强的专业知识和生物信息学支持。

3、技术限制

某些蛋白质可能由于表达水平低或结构特点不易检测。

四、高通量蛋白质相互作用实验注意事项

1、实验设计

合理设计实验，选择合适的对照组和重复次数，以确保数据的可靠性。

2、样品处理

严格控制样品处理过程中的条件，以避免样品降解或非特异性结合的发生。

3、数据验证

采用多种独立方法对重要结果进行验证，提高结果的可信度。

百泰派克生物科技致力于为客户提供高效、精准的科研解决方案。我们的专家团队拥有丰富的经验及专业知识，能够根据客户的具体需求，制定个性化的研究方案。我们的服务确保数据的准确和可靠，是您科研路上值得信赖的合作伙伴。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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