C端测序（C-terminal sequencing）是一种专门用于分析蛋白质C端序列的技术。在蛋白质组学研究中，氨基酸序列的解析对蛋白功能的研究至关重要。然而，与经典的N端测序相比，C端序列分析的技术发展较晚且难度更大，主要受到酶解策略、化学修饰及测序方法的限制。近年来，随着蛋白质组学技术的进步，其在精准蛋白组学、蛋白降解研究及翻译后修饰分析等领域的应用价值逐渐凸显。

一、原理

C端测序的基本原理依赖于特异性的化学或酶学方法，使蛋白质的C端残基能够被逐步解析。由于C端通常较难直接降解，目前的测序方法主要包括化学降解、酶促降解和质谱分析相结合的策略。其中，化学降解法通过特定试剂选择性裂解C端残基，逐步释放末端氨基酸；而酶促降解则借助特定蛋白酶（如羧肽酶）逐级水解C端氨基酸，再结合色谱或质谱检测获得序列信息。此外，现代质谱技术（如LC-MS/MS）能够提供更高分辨率的数据，通过高能碎裂策略（如HCD、ETD等）提升对C端结构的解析能力。

二、优势

虽然C端测序在蛋白质组学中发展相对较晚，但它在特定研究领域中展现出独特优势。首先，相比N端测序，C端序列分析更适用于分析具有封闭N端修饰（如乙酰化、甲基化）的蛋白质，这些修饰会阻碍经典Edman降解法的应用。其次，在蛋白质翻译后修饰（PTMs）研究中，C端的特定修饰（如泛素化、酪蛋白激酶相关修饰）对蛋白稳定性和降解途径具有调控作用，C端测序技术在解析这些修饰对蛋白命运的影响方面具有独特价值。此外，在蛋白质降解研究（如泛素-蛋白酶体系统和溶酶体降解途径）中，C端序列信息可以揭示底物蛋白的降解信号，从而为蛋白稳态调控研究提供更深入的视角。

三、局限性

C端测序技术在蛋白质研究中还是面临一些问题。首先，由于C端残基的化学性质较为复杂，传统化学降解方法的效率较低，且对某些氨基酸（如脯氨酸、羟基氨基酸等）降解较难控制，可能影响测序准确性。其次，酶促降解法依赖于特定的羧肽酶，而不同蛋白质的C端序列环境会影响酶的切割特异性，导致某些蛋白质难以解析。此外，质谱法虽然展现出较高灵敏度，但对低丰度蛋白的检测仍然具有一定局限性，尤其是在复杂生物样本背景下，C端肽段的信号易受干扰。

随着蛋白质组学技术的不断进步，C端测序技术仍在持续优化。未来的发展方向包括：开发更高效、特异性更强的C端化学降解方法，以提高测序的准确性；优化酶促降解策略，通过基因工程改造酶类提升其C端特异性切割能力；结合最新的质谱技术，如单分子质谱或增强型串联质谱（如TIMS-TOF、Orbitrap Fusion等），提升C端肽段的检测灵敏度。另外，结合生物信息学方法，开发针对C端序列的精准数据分析算法，将有助于从复杂蛋白组学数据中挖掘更具生物学意义的信息。百泰派克生物科技7大质量控制检测平台，满足您一站式蛋白质N/C端测序服务需求，致力于为您提供优质的生物质谱分析服务！

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

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